HoloFood Data Portal
Access samples and data collected and generated by the HoloFood project.
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| Accession | Species representative | Taxonomy | Species rep. detail | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| MGYG000308801 | MGYG000312616 |
Escherichia coli
Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacterales > Enterobacteriaceae > Escherichia > Escherichia coli
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| MGYG000308802 | MGYG000311580 |
Coproplasma stercorigallinarum
Bacteria > Firmicutes_A > Clostridia > Christensenellales > Borkfalkiaceae > Coproplasma > Coproplasma stercorigallinarum
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| MGYG000308803 | MGYG000317304 |
Phocaeicola merdavium
Bacteria > Bacteroidota > Bacteroidia > Bacteroidales > Bacteroidaceae > Phocaeicola > Phocaeicola merdavium
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| MGYG000308804 | MGYG000318314 |
Caccovivens
Bacteria > Firmicutes_A > Clostridia > Christensenellales > UBA1242 > Caccovivens
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| MGYG000308805 | MGYG000314896 |
Caccousia avicola
Bacteria > Firmicutes_A > Clostridia > Oscillospirales > Acutalibacteraceae > Caccousia > Caccousia avicola
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| MGYG000308806 | MGYG000318167 |
Ventrisoma faecale
Bacteria > Firmicutes_A > Clostridia > Lachnospirales > Lachnospiraceae > Ventrisoma > Ventrisoma faecale
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| MGYG000308807 | MGYG000308307 |
Limosilactobacillus oris
Bacteria > Firmicutes > Bacilli > Lactobacillales > Lactobacillaceae > Limosilactobacillus > Limosilactobacillus oris
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| MGYG000308808 | MGYG000314949 |
Lactobacillus gallinarum
Bacteria > Firmicutes > Bacilli > Lactobacillales > Lactobacillaceae > Lactobacillus > Lactobacillus gallinarum
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| MGYG000308809 | MGYG000313705 |
Enorma massiliensis
Bacteria > Actinobacteriota > Coriobacteriia > Coriobacteriales > Coriobacteriaceae > Enorma > Enorma massiliensis
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| MGYG000308810 | MGYG000319711 |
Faecalibacterium faecigallinarum
Bacteria > Firmicutes_A > Clostridia > Oscillospirales > Ruminococcaceae > Faecalibacterium > Faecalibacterium faecigallinarum
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Documents written by HoloFood partners and collaborators relevant to the HoloFood Chicken Gut v2 Genome Catalogue