HoloFood Data Portal
Access samples and data collected and generated by the HoloFood project.
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| Accession | Species representative | Taxonomy | Species rep. detail | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| MGYG000308841 | MGYG000317399 |
Gallimonas
Bacteria > Firmicutes_A > Clostridia > Christensenellales > Borkfalkiaceae > Gallimonas
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| MGYG000308842 | MGYG000313438 |
Agathobaculum stercoravium
Bacteria > Firmicutes_A > Clostridia > Oscillospirales > Butyricicoccaceae > Agathobaculum > Agathobaculum stercoravium
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| MGYG000308843 | MGYG000309035 |
Scatavimonas merdigallinarum
Bacteria > Firmicutes_A > Clostridia > Oscillospirales > Acutalibacteraceae > Scatavimonas > Scatavimonas merdigallinarum
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| MGYG000308844 | MGYG000319845 |
Blautia_A intestinavium
Bacteria > Firmicutes_A > Clostridia > Lachnospirales > Lachnospiraceae > Blautia_A > Blautia_A intestinavium
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| MGYG000308845 | MGYG000312616 |
Escherichia coli
Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacterales > Enterobacteriaceae > Escherichia > Escherichia coli
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| MGYG000308846 | MGYG000308846 |
Protoclostridium
Bacteria > Firmicutes_A > Clostridia > Christensenellales > CAG-552 > Protoclostridium
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| MGYG000308847 | MGYG000310350 |
Lachnoclostridium_B stercoravium
Bacteria > Firmicutes_A > Clostridia > Lachnospirales > Lachnospiraceae > Lachnoclostridium_B > Lachnoclostridium_B stercoravium
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| MGYG000308848 | MGYG000310892 |
Intestinimonas pullistercoris
Bacteria > Firmicutes_A > Clostridia > Oscillospirales > Oscillospiraceae > Intestinimonas > Intestinimonas pullistercoris
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| MGYG000308849 | MGYG000308849 |
Caccovivens
Bacteria > Firmicutes_A > Clostridia > Christensenellales > UBA1242 > Caccovivens
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| MGYG000308850 | MGYG000315561 |
Massiliomicrobiota merdigallinarum
Bacteria > Firmicutes > Bacilli > Erysipelotrichales > Coprobacillaceae > Massiliomicrobiota > Massiliomicrobiota merdigallinarum
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Documents written by HoloFood partners and collaborators relevant to the HoloFood Chicken Gut v2 Genome Catalogue