HoloFood Data Portal
Access samples and data collected and generated by the HoloFood project.
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| Accession | Species representative | Taxonomy | Species rep. detail | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| MGYG000308581 | MGYG000320731 |
Bacteroides merdavium
Bacteria > Bacteroidota > Bacteroidia > Bacteroidales > Bacteroidaceae > Bacteroides > Bacteroides merdavium
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| MGYG000308582 | MGYG000319711 |
Faecalibacterium faecigallinarum
Bacteria > Firmicutes_A > Clostridia > Oscillospirales > Ruminococcaceae > Faecalibacterium > Faecalibacterium faecigallinarum
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| MGYG000308583 | MGYG000317725 |
Bacteroides fragilis_A
Bacteria > Bacteroidota > Bacteroidia > Bacteroidales > Bacteroidaceae > Bacteroides > Bacteroides fragilis_A
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| MGYG000308584 | MGYG000308269 |
Ligilactobacillus agilis
Bacteria > Firmicutes > Bacilli > Lactobacillales > Lactobacillaceae > Ligilactobacillus > Ligilactobacillus agilis
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| MGYG000308585 | MGYG000312616 |
Escherichia coli
Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacterales > Enterobacteriaceae > Escherichia > Escherichia coli
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| MGYG000308586 | MGYG000318668 |
Coproplasma stercoripullorum
Bacteria > Firmicutes_A > Clostridia > Christensenellales > Borkfalkiaceae > Coproplasma > Coproplasma stercoripullorum
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| MGYG000308587 | MGYG000317985 |
Erysipelatoclostridium spiroforme
Bacteria > Firmicutes > Bacilli > Erysipelotrichales > Coprobacillaceae > Erysipelatoclostridium > Erysipelatoclostridium spiroforme
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| MGYG000308588 | MGYG000315561 |
Massiliomicrobiota merdigallinarum
Bacteria > Firmicutes > Bacilli > Erysipelotrichales > Coprobacillaceae > Massiliomicrobiota > Massiliomicrobiota merdigallinarum
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| MGYG000308589 | MGYG000319095 |
Neoanaerotignum_A tabaqchaliae
Bacteria > Firmicutes_A > Clostridia > Lachnospirales > Anaerotignaceae > Neoanaerotignum_A > Neoanaerotignum_A tabaqchaliae
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| MGYG000308590 | MGYG000315409 |
Onthovicinus excrementipullorum
Bacteria > Firmicutes_A > Clostridia > Oscillospirales > Acutalibacteraceae > Onthovicinus > Onthovicinus excrementipullorum
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Documents written by HoloFood partners and collaborators relevant to the HoloFood Chicken Gut v2 Genome Catalogue