HoloFood Data Portal
Access samples and data collected and generated by the HoloFood project.
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Viral region
| Viral sequence ID | Parent contig | Type | Taxonomy | View | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ERZ2641819.159-NODE-159-length-140814-cov-73.809135|prophage-9395:99995 | ERZ2641819.159-NODE-159-length-140814-cov-73.809135 | prophage | — | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cluster representative of 24 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ERZ2641819.16050-NODE-16050-length-5309-cov-14.219262|viral_sequence | ERZ2641819.16050-NODE-16050-length-5309-cov-14.219262 | viral_sequence | — | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cluster representative of 0 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ERZ2641819.16215-NODE-16215-length-5252-cov-5.666538|viral_sequence | ERZ2641819.16215-NODE-16215-length-5252-cov-5.666538 | viral_sequence | Spounavirinae | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cluster representative of 1 other viral fragment. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ERZ2641819.1629-NODE-1629-length-39194-cov-11.720151|viral_sequence | ERZ2641819.1629-NODE-1629-length-39194-cov-11.720151 | viral_sequence | — | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cluster representative of 0 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ERZ2641819.1632-NODE-1632-length-39158-cov-24.644426|viral_sequence | ERZ2641819.1632-NODE-1632-length-39158-cov-24.644426 | viral_sequence | — | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cluster representative of 11 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ERZ2641819.16366-NODE-16366-length-5206-cov-5.596001|viral_sequence | ERZ2641819.16366-NODE-16366-length-5206-cov-5.596001 | viral_sequence | — | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cluster representative of 0 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ERZ2641819.1660-NODE-1660-length-38779-cov-7.248425|viral_sequence | ERZ2641819.1660-NODE-1660-length-38779-cov-7.248425 | viral_sequence | Nymbaxtervirinae | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cluster representative of 13 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ERZ2641819.1676-NODE-1676-length-38423-cov-43.823421|viral_sequence | ERZ2641819.1676-NODE-1676-length-38423-cov-43.823421 | viral_sequence | — | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cluster representative of 8 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ERZ2641819.16976-NODE-16976-length-5010-cov-1093.479112|viral_sequence | ERZ2641819.16976-NODE-16976-length-5010-cov-1093.479112 | viral_sequence | Parvovirinae | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cluster representative of 0 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ERZ2641819.1703-NODE-1703-length-38075-cov-10.117412|viral_sequence | ERZ2641819.1703-NODE-1703-length-38075-cov-10.117412 | viral_sequence | Arquatrovirinae | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cluster representative of 7 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Documents written by HoloFood partners and collaborators relevant to the Chicken Gut v1.0 Viral Catalogue