HoloFood Data Portal
Access samples and data collected and generated by the HoloFood project.
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Viral region
| Viral sequence ID | Parent contig | Type | Taxonomy | View | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ERZ2641819.1157-NODE-1157-length-49261-cov-23.721457_181_538|prophage-1:32364 | ERZ2641819.1157-NODE-1157-length-49261-cov-23.721457_181_538 | prophage | — | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cluster representative of 12 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ERZ2641819.11592-NODE-11592-length-7306-cov-17.336919|viral_sequence | ERZ2641819.11592-NODE-11592-length-7306-cov-17.336919 | viral_sequence | — | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cluster representative of 1 other viral fragment. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ERZ2641819.11709-NODE-11709-length-7239-cov-4.832127|viral_sequence | ERZ2641819.11709-NODE-11709-length-7239-cov-4.832127 | viral_sequence | — | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cluster representative of 0 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ERZ2641819.11736-NODE-11736-length-7222-cov-10.231896|viral_sequence | ERZ2641819.11736-NODE-11736-length-7222-cov-10.231896 | viral_sequence | — | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cluster representative of 2 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ERZ2641819.11766-NODE-11766-length-7202-cov-9.969917|viral_sequence | ERZ2641819.11766-NODE-11766-length-7202-cov-9.969917 | viral_sequence | — | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cluster representative of 1 other viral fragment. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ERZ2641819.12150-NODE-12150-length-6953-cov-27.242824|viral_sequence | ERZ2641819.12150-NODE-12150-length-6953-cov-27.242824 | viral_sequence | — | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cluster representative of 0 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ERZ2641819.12200-NODE-12200-length-6916-cov-12.117184|viral_sequence | ERZ2641819.12200-NODE-12200-length-6916-cov-12.117184 | viral_sequence | Ounavirinae | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cluster representative of 1 other viral fragment. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ERZ2641819.12233-NODE-12233-length-6903-cov-8.814398|viral_sequence | ERZ2641819.12233-NODE-12233-length-6903-cov-8.814398 | viral_sequence | — | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cluster representative of 2 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ERZ2641819.1233-NODE-1233-length-47426-cov-19.431044|viral_sequence | ERZ2641819.1233-NODE-1233-length-47426-cov-19.431044 | viral_sequence | Nymbaxtervirinae | Viewing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cluster representative of 101 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ERZ2641819.12356-NODE-12356-length-6838-cov-10.125313|viral_sequence | ERZ2641819.12356-NODE-12356-length-6838-cov-10.125313 | viral_sequence | Arquatrovirinae | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cluster representative of 0 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Documents written by HoloFood partners and collaborators relevant to the Chicken Gut v1.0 Viral Catalogue