Access samples and data collected and generated by the HoloFood project.
Viral region
Viral sequence ID | Parent contig | Type | Taxonomy | View | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ERZ11806476.59-NODE-59-length-34892-cov-10.920372|viral_sequence | ERZ11806476.59-NODE-59-length-34892-cov-10.920372 | viral_sequence | Sepvirinae | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cluster representative of 15 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ERZ11806476.950-NODE-950-length-3507-cov-4.887891|viral_sequence | ERZ11806476.950-NODE-950-length-3507-cov-4.887891 | viral_sequence | — | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cluster representative of 0 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ERZ11806477.1-NODE-1-length-135066-cov-12.680522|prophage-257:80463 | ERZ11806477.1-NODE-1-length-135066-cov-12.680522 | prophage | — | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cluster representative of 41 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ERZ11806477.140-NODE-140-length-13599-cov-7.685691|viral_sequence | ERZ11806477.140-NODE-140-length-13599-cov-7.685691 | viral_sequence | — | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cluster representative of 6 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ERZ11806477.26-NODE-26-length-42731-cov-12.939216|viral_sequence | ERZ11806477.26-NODE-26-length-42731-cov-12.939216 | viral_sequence | Arquatrovirinae | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cluster representative of 42 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ERZ11806477.288-NODE-288-length-6456-cov-5.114670|viral_sequence | ERZ11806477.288-NODE-288-length-6456-cov-5.114670 | viral_sequence | Arquatrovirinae | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cluster representative of 3 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ERZ11806477.324-NODE-324-length-5840-cov-6.219188|viral_sequence | ERZ11806477.324-NODE-324-length-5840-cov-6.219188 | viral_sequence | Brockvirinae | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cluster representative of 0 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ERZ11806477.33-NODE-33-length-37863-cov-8.315145|viral_sequence | ERZ11806477.33-NODE-33-length-37863-cov-8.315145 | viral_sequence | Tunavirinae | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cluster representative of 24 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ERZ11806477.455-NODE-455-length-4154-cov-6.223469|viral_sequence | ERZ11806477.455-NODE-455-length-4154-cov-6.223469 | viral_sequence | Arquatrovirinae | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cluster representative of 0 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ERZ11806477.491-NODE-491-length-3851-cov-6.893309|viral_sequence | ERZ11806477.491-NODE-491-length-3851-cov-6.893309 | viral_sequence | — | View contig | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cluster representative of 0 other viral fragments. View cluster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Documents written by HoloFood partners and collaborators relevant to the Chicken Gut v1.0 Viral Catalogue